Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm29094F6Q785 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms