Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc74aE9Q9U8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms