Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp17lbE9Q9U0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17lbE9Q9U0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms