Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
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Gm5407E9Q7Q1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Gm5407E9Q7Q1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Gm5407E9Q7Q1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Gm5407E9Q7Q1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Gm5407E9Q7Q1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Gm5407E9Q7Q1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Gm5407E9Q7Q1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Gm5407E9Q7Q1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Gm5407E9Q7Q1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Gm5407E9Q7Q1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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Gm5407E9Q7Q1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Gm5407E9Q7Q1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Gm5407E9Q7Q1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5407E9Q7Q1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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