Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC030500E9Q6W0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC030500E9Q6W0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms