Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Simc1E9Q6E9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Simc1E9Q6E9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Simc1E9Q6E9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms