Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FancfE9Q5Z5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FancfE9Q5Z5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FancfE9Q5Z5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FancfE9Q5Z5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FancfE9Q5Z5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FancfE9Q5Z5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FancfE9Q5Z5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FancfE9Q5Z5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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