Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrp3E9Q1T6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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