Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sbf2E9PXF8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbf2E9PXF8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sbf2E9PXF8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbf2E9PXF8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbf2E9PXF8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbf2E9PXF8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbf2E9PXF8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbf2E9PXF8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbf2E9PXF8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms