Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm9008E9PVG0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm9008E9PVG0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms