Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms