Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Piezo1E2JF22 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Piezo1E2JF22 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Piezo1E2JF22 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms