Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Cngb1E1AZ71 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Cngb1E1AZ71 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.9 ms