Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl3E0CZ16 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl3E0CZ16 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl3E0CZ16 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Klhl3E0CZ16 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl3E0CZ16 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms