Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.6 ms