Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
4930467E23RikD3Z1P8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
4930467E23RikD3Z1P8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930467E23RikD3Z1P8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930467E23RikD3Z1P8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930467E23RikD3Z1P8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930467E23RikD3Z1P8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930467E23RikD3Z1P8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930467E23RikD3Z1P8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930467E23RikD3Z1P8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930467E23RikD3Z1P8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930467E23RikD3Z1P8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930467E23RikD3Z1P8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930467E23RikD3Z1P8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930467E23RikD3Z1P8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930467E23RikD3Z1P8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930467E23RikD3Z1P8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930467E23RikD3Z1P8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms