Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem200bD3Z0P8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms