Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc170D3YXL0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms