Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd1D3YXK1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd1D3YXK1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms