Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC048679D3YXE9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms