Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms