Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptprz1B9EKR1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptprz1B9EKR1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms