Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Clip3B9EHT4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Clip3B9EHT4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms