Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf11cB4XVP9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms