Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc11B2RXC1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms