Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms