Protein–RNA interactions for Protein: B2RVA4

Gm5741, Guanine nucleotide-binding protein subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 72 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5741B2RVA4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5741B2RVA4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5741B2RVA4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms