Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc22a28B2RT89 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc22a28B2RT89 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms