Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf3B2RQG2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms