Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.56■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.55■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
AU022751B1B0V2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms