Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scml2B1AVB3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms