Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtpruB1AUH1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtpruB1AUH1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
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