Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
1700042G07RikB1AUF7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms