Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
1700084M14RikB1AT01 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700084M14RikB1AT01 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms