Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms