Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skint7A7XV04 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms