Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Skint5A7XUY5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms