Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
4930435E12RikA6X8Z9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms