Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf2A3KGV1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odf2A3KGV1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms