Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc9bA3KGF9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc9bA3KGF9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms