Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp8b5A3FIN4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp8b5A3FIN4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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