Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r232A2RTT5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms