Protein–RNA interactions for Protein: A2RT62

Fbxl16, F-box/LRR-repeat protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl16A2RT62 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxl16A2RT62 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxl16A2RT62 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxl16A2RT62 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxl16A2RT62 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxl16A2RT62 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxl16A2RT62 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxl16A2RT62 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxl16A2RT62 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxl16A2RT62 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxl16A2RT62 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxl16A2RT62 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxl16A2RT62 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxl16A2RT62 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxl16A2RT62 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxl16A2RT62 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxl16A2RT62 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxl16A2RT62 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxl16A2RT62 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms