Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn3aA2ASI5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn3aA2ASI5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms