Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox3fA2ANE1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox3fA2ANE1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox3fA2ANE1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox3fA2ANE1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox3fA2ANE1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox3fA2ANE1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox3fA2ANE1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox3fA2ANE1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox3fA2ANE1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox3fA2ANE1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox3fA2ANE1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox3fA2ANE1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox3fA2ANE1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox3fA2ANE1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox3fA2ANE1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms