Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34c4A2ANA3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34c4A2ANA3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34c4A2ANA3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34c4A2ANA3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34c4A2ANA3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34c4A2ANA3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34c4A2ANA3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34c4A2ANA3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34c4A2ANA3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34c4A2ANA3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34c4A2ANA3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34c4A2ANA3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34c4A2ANA3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms