Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc183A2AJB1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms