Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prdm12A2AJ77 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms