Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ambra1A2AH22 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms