Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm11A2AGX3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm11A2AGX3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm11A2AGX3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm11A2AGX3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm11A2AGX3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm11A2AGX3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm11A2AGX3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm11A2AGX3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm11A2AGX3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prdm11A2AGX3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prdm11A2AGX3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms